Nguyên liệu làm bánh phu thê gồm tinh bột nếp cái hoa vàng, đỗ xanh, đu đủ xanh, hạt sen, cơm dừa... Vỏ bánh được làm từ gạo nếp cái hoa vàng có tuyển chọn để tinh bột làm ra trắng mịn, dẻo và thơm. Một cân gạo nếp cái hoa vàng sau khi lọc thu được 400 gram tinh bột. Bột phải được phơi hoặc sấy khô, để qua 15 ngày mới đem ra làm bánh.
Bột được trộn với sợi đu đủ xanh, đường hoa mai và nước quả dành dành, để khoảng 30 phút mới bắt đầu bọc nhân.
Bánh phu thê được tạo màu tự nhiên từ nước quả dành dành khô tiết ra khi đun sôi. Nước dành dành cũng phải được thêm theo tỉ lệ để ra được đúng màu vàng tươi, không bị nhạt cũng không quá đậm khiến bánh bị xỉn màu.
Nhân bánh là đỗ xanh được ngâm kỹ, đãi sạch vỏ, đem hấp chín, nghiền mịn. Thêm đường, hạt sen và sợi dừa nạo, trộn đều rồi đổ vào từng khuôn hình chữ nhật để nguội. Đáy mỗi khuôn đều chia sẵn các ô hình vuông, mỗi ô là khối lượng nhân của một chiếc bánh. Sau khi nhân nguội thì bắt đầu công đoạn gói.
Bánh sau khi gói xong được hấp cách thủy từ 40 đến 60 phút. Khi bánh chín, hương thơm khó cưỡng. Vỏ bánh màu vàng ươm, thoạt nhìn trong như thạch. Khi bóc tách từng lớp lá chuối bọc bên ngoài, bánh từ từ rời ra và trở về nguyên trạng, không bị biến dạng.
Trái ngược với độ dẻo và dai của vỏ bánh, phần nhân đậu xanh bên trong có màu nhạt hơn, bở, ngọt bùi. Sợi đu đủ và dừa nạo giòn sần sật trong miệng khi nhai. Bánh có vị ngọt thanh, dễ chịu nơi đầu lưỡi.
Vì không sử dụng chất bảo quản, bánh phu thê chỉ để ở ngoài khoảng 3 ngày và để trong tủ lạnh 7 ngày.